原代细胞：从体内直接分离的细胞。功能、代谢、形态类似体内细胞的特点，因此原代细胞适用于分析单个细胞形态、代谢、功能。原代细胞的缺点是：细胞均一性差，因为从特定组织取下来的原代细胞可能处于不同的发育时期。增殖能力差、培养时间受限、转染效率低。

细胞株：原代细胞经过长期培养和筛选后，功能、代谢、形态趋于均一化的无限增殖细胞。适用于整体水平实验。优点是：容易培养、好感染、干扰因素少、便于同步化、实验好操作。缺点是：与整体差别大、可能丧失原代细胞的特性，细胞株在长期传代过程中遗传物质发生变异。所以同一个学名的细胞株，有可能有完全不同的形态、代谢、功能表现。不同代数的细胞株，性质也可能完全不同。

原代细胞由于转染效率低这个问题，应用受到了限制。自从腺病毒诞生后，因为其超强的感染能力，克服了原代细胞难感染的问题，使得原代细胞的使用变得更加简单。由于细胞实验后，很多时候需要做到动物体内，由于原代细胞有体内细胞的特点，为了细胞实验和动物体内实验的结果更加趋向一致性，因此用原代细胞来进行细胞实验更值得考虑。